格列佛在经历过小人国和巨人国的行程后，又开始了第三次出海。这次出海他继续遇到了意外。他的船先遇到风暴，然后被海盗所劫持，格列佛独自一人被放入独木舟，被迫漂流了五天，最后他看见一个飞行的岛屿，被救到了飞岛上。
这个国家只重视数学和音乐，而其他的的知识却一无所知。这个国家的国王是一个霸道、残忍的殖民主义者，因为国王的压迫，导致了人民的反抗，成为一种恶性循环。当格列佛问飞岛国国王怎么治理反抗时，国王说用飞岛并详细地与格列佛说明。在这里作者写出“飞岛”是统治者统治人民的工具，讽刺了英国对爱尔兰的统治与剥削。
在这一章中，让我印象最深的是格列佛参观飞岛国首都科技院，在科技园中，科学家们从事研究如何从黄瓜中提取阳光、把冰烧成火药等等不和实际的研究。在这个故事中，作者把飞岛国首都科技院影射的是英国皇家科技院。体现作者对不切实际的脱离生产的所谓科学研究很反感，讽刺了当时英国科学界可笑迂腐的行为，并对这种行为进行了谴责。
格列佛在经历了荒诞的科学院后，又到了巫人岛并借鬼魂之口，抒发了作者的思想、观点与情感，体现出作者的仁爱、正直与主张共和，反对独裁的性格特征。
作者在经历飞岛国后坐船去到日本国，并在日本坐船回到英国。虽然飞岛国是假的，但是“日本国”是真的，以真支撑假，使虚构巧妙，饶有趣味。